康熙六年，吴三桂以目疾为由，自请解除总管云贵两省事务，以相试探。

康熙帝顺水推舟，遂命吴三桂将所管各项事务交出，并责令云贵两省督抚接权管理。结果，云贵总督卞三元、提督张国柱、李本深却没有照办，反而合词请命，要求康熙同意由吴三桂继续总管滇黔事务。

当时，康熙以照顾吴三桂身体为理由，拒绝了他们的请求。与此同时，清政府还剥夺了吴三桂的司法特权，谕令：“平西藩下逃人，俱归有司审理，章京不得干预”。

吴三桂因此受到了不小的刺激，于是很快就想出了一个办法来报复清政府。他借口苗蛮难以管理，有暴动的可能，不断扩军，像清政府索取大量军饷。

由此，吴三桂和清政府之间的矛盾更加尖锐了。

值得注意的是，康熙六年的时候，主政的并非康熙，而是四辅臣，说白了，也就是鳌拜。因此，那个阶段，也可以认为是吴三桂与鳌拜的较量。

到了康熙十二年春，康熙主政。镇守广东的平南王尚可喜疏请归老辽东，康熙皇帝遂乘势作出了令其移藩的决定。而后，镇守福建的靖南王耿精忠也提出了撤藩要求，于是，康熙帝也依例照准了。

在形势的逼迫下，吴三桂也只得假惺惺地上书朝廷，请求撤藩，实则希冀朝廷慰留他。

对于吴三桂的真实意图，康熙皇帝非常清楚。

他认为，吴三桂和朝廷对立已久，撤亦反，不撤亦反。如果朝廷先发制人，说不定还能控制住他。否则再继续姑息下去，可能会养成大患。于是，他力排众议，不顾索额图等人的反对，毅然决定同意他的撤藩请求。不仅如此，他还特意派出专使前往云南，雷厉风行地办理撤藩事宜。

众所周知，吴三桂、耿精忠疏请移藩，其实是迫于形势，并非本意。

吴三桂一直心存幻想，希望朝廷慰留，谁知，最终竟会等来撤藩的圣旨，自然愕然失望，对清廷心灰意冷。于是，同年十一月，吴三桂诛杀云南巡抚朱国治，自称天下都招讨兵马大元帅，提出“兴明讨虏”，起兵造反。

由于吴三桂专制滇中十四年，因此在反叛之初，叛军气势如虹，连下贵州全省以及湖南的衡州。福建靖南王、广东平南王以及吴三桂在各地的党羽，如镇守四川的郑蛟麟、谭弘、吴之茂，镇守广西的罗森、孙延龄还有镇守陕西的王辅臣、河北的蔡禄等也先后揭起叛旗，纷纷响应。

一时之间，清廷根本来不及反应，顿时陷入被动，形势对吴三桂一方非常有利。

当时，天下骚动，福建、广东、广西、陕西、湖北、河南还有台湾的郑成功等都迅速响应。这些地方都有汉官、汉兵、汉民，以及明朝旧时的士大夫们，他们听说了吴三桂讨伐清廷的事，都拍手叫好，前往投奔。

面对摇摇欲坠的江山，康熙一筹莫展，清廷上下人心惶惶。一直不赞成撤藩的索额图立刻进宫献言，认为这是撤藩导致的激变，因此请求康熙将当初建议撤藩的人处死，以平息吴三桂的愤怒。

他的这种说辞，显然是年轻气盛的康熙帝所不能接受的，毕竟，当初他才是坚持撤藩那伙人中最坚定的一个。此时若处置他们，无异于自己打脸。因此，索额图遭到了康熙帝斥责。

年轻的康熙帝坚持己见，认为吴三桂不能招安，必须要除。他想要御驾亲征，到前线杀敌，但索额图还是认为不可，坚持要他开议政王大臣会议议论此事。最终，经议政大臣密议，这件事就此作罢。

然而，形势依然严峻。那时的清军，东征西讨，顾此失彼。根本无力从吴三桂手中收复失地。此外，四川的几个土司、苗民，察哈尔的布尔尼、青海的墨尔根台吉等少数民族也乘火打劫，相继响应吴三桂的行动，加入了混战。

康熙十二年十一月至康熙十五年七月，这两年半中，吴三桂占据优势，改元称帝，在南方正式做起了皇帝。

事情发展到这一步，事实已经证明康熙盲目“撤藩”的做法是错误的。

其实，不仅如此，如果从中国历代强盛王朝撤藩的历史来看，康熙此举，也是十分冒险的。

如果康熙皇帝多读一些历史书，他就会发现，大清以前的历代强盛王朝，其实都存在着如何撤藩的问题。每一次的武力撤藩，都会给国家带来重大的损失，给人民带来巨大的灾难！

只是那时的康熙年轻气盛，根本听不进别人的劝谏，因此才给自己的统治造成了一场几乎可以致死的巨大危机！

何谓忠臣？大概就是当君主做出错误决断时，据理力争、竭力阻止；当君主一意孤行，酿成大祸时，又不离不弃，陪着他把损失降到最低；当君主坚持要一条道儿走到黑的时候，又不抛弃不放弃，不管他是对是错，陪着他一起走到黑……

索额图对康熙，基本上就是这样。康熙要撤藩时，他竭力阻止，后来吴三桂军占优势的时候，他又想方设法去挽回局势，虽然再一次遭到拒绝，他却仍旧没有就此放弃，而是继续陪在康熙的身边，为他出谋划策，陪伴他度过了最为艰难的一段时间