佛保、段武达、尉迟敬德四人。
从而保证自己对军队拥有绝对的控制。
又设置六大都护府，西域、岭南、陇右、辽东、北庭、安西。
以岭南豪族首领冯盎任岭南大都护，薛万彻为陇右大都护，李药师为辽东大都护，李肃为安西大都护，李沧为北庭大都护，罗士襄为西域大都护。
又将天策府裁撤，诸军皆隶属于北衙，保留“神策”“天武”“背嵬”“神武”“骁果”“捧日”六个军号，共三万人。设统军总管，位比大将军，北衙禁军。
神策军总管张琼，天武军总管傅惟学，背嵬军总管王杰，骁果军总管裴行严，捧日军总管羊献果，神武军总管娄浚。
以慕容三藏为西兖州都督，李大目为青州都督，黄君汉为荆州都督，李承安为扬州都督，李延宗为夏州都督，薛仁美为东兖州都督。侯浚为北豫州都督。
兴明二年，改封蜀王李承乾为秦王，封太宗子李承治为蜀王，世祖子李承泽为晋王。并高祖之子六人，皆为亲王。
并设宗学，诸子弟都要学习典章制度，经史礼法，武艺骑射。
同时成立宗团骠骑，皆以宗室子弟，并陇西李氏姑藏房、敦煌房、丹阳房、狄道房四支子弟，并以骠骑大将军李承道领之。
兴明二年，礼部上奏，文武百官的妻子品级应该由皇后发布，皇后慕容氏谢绝，并表示这会带来妇人干政之风，我不能开这个头。
于是朝野皆称赞慕容氏乃贤后。并有人上奏，请立嫡长子为太子。
其实这时候登基三年的李元徽已经对朝堂完成了掌控，但他并没有同意立太子的事，但也没提金匮之盟。
兴明三年四月，下诏幽州都督、征北大将军、镇国公常雁衡率十万大军北伐辽东，大军渡过辽水，攻克襄平。俘虏三万高句丽士卒，尽坑之。
李元徽闻言下诏斥责，然后决定原本给常雁衡曾加一千户食邑，削减到九百户.嗯就相当罚酒三杯。随后又诏其还都，以左骁卫将军徐懋功代其为幽州都督，镇北将军。
常雁衡入京后，李元徽封其冠军大将军，赐其长安府邸。
四年秋，高昌王断绝西域朝贡通道，李元徽闻言大怒，欲伐之。
朝野皆言不可，此战唐军要长途跋涉，所经之地又是沙漠，行军困难。另外，很多朝臣都认为高昌远在万里之外，就算唐军得胜，恐怕也难以守住此地。冠军大将军常雁衡入宫请战，李元徽虑其身体多病，想要让他长安修养，常雁衡在三请求，乃命其交河道大总管。薛万均、傅唯学、裴行俨为副总管，发兵两万骑。
十二月，常雁衡率部出征。经过三个月跋涉，唐军赶到了高昌，然后秋风扫落叶一般的灭了高昌王国，得三郡、五县、二十二城，得户八千，人口四万，马四千五百，占地东西八百里，南北五百里。唐在其地置西州，在可汗浮图城置庭州。又置安西都护府于交河城，留兵镇守。
不过常雁衡本人却病逝于归途，临终之前，对自己的儿子常林和小舅子蓝誉嘱咐道：“我本淮南盗匪，蒙主上不弃，拣拔为将，三十余年征战，如今马革裹尸，也算对得起主上大恩了。”李元徽闻言哀伤不已，命次子李承道去迎灵柩，辍朝三日。
并“写了”自己唯一的一首诗：“朕有千行生铁汁，平生不为儿女泣。忽闻昨日常公薨，泪洒乾坤草木湿”
等到常雁衡灵柩回到长安之后，李元徽又亲自赶往常宅上了一炷香，全君臣之谊。赠“骠骑大将军”“太尉”“上柱国”“太保”“开平王”。
给出了最高规格的谥号“忠武”。自从诸葛亮之后，忠武就被视为谥号最高的级别。
并谓众人言：“雁衡爱抚士卒每与敌战，出则当先，退则殿后，士卒乐之用沉鸷果敢，摧锋陷阵，未尝败北。虽不习书史，用兵辄与古合。虽古名将，未有过之。”
兴明五年七月，右仆射杜克明上奏，李元徽下诏减免徭役，一切从简。
八月，侍中独孤颍进言，天下因为战乱的关系，多地使用的钱币不一样，西魏、东魏、北汉、前燕甚至前魏都有货币留存，加上各种民间私自铸造的钱币，轻重成色不同，都在市场上流通，价值混轮，甚至蜀中地区还有使用刘备时期的直百钱，这对于贸易和税收来讲非常的不便利。
于是下诏重新铸造五铢钱，新钱的铸造技术也十分高级，正面背面钱孔边缘都有凸起轮廓，每一千枚重四斤二两。全面禁止古钱和私钱，在所有关口、市场放置新钱样品，旧钱要在规定时间内全部换成新钱，私自使用全部没收销毁。
同时把私铸钱币列为了重大犯罪。将铸币权全部收回朝廷所有。
在铸币之后，李元徽又命人重新订立律法，死刑只保留斩和绞两种，并且要三次附议。五马分尸、凌迟等残酷刑法全部都废除了，同时也废除了宫刑、鞭刑等伤人肢体的刑法。
以笞、仗、徙、流、死五种手段为基本刑法。
而这套重新订立的律法，也真是被定名为《唐律》，也被后世称为《兴明律》。基本上成为后世的律法的蓝本。
律法之后，年富力强的李元徽再次对内部动刀了，下令九品以上官员，全部都需要中枢任免，文官由吏部掌握，武官由兵部遴选，禁止地方私自就